Affymetrix miRNA 4.0 芯片服務(wù)

上海伯豪生物技術(shù)有限公司（Shanghai Biotechnology Corporation）作為上海生物芯片有限公司/生物芯片上海國家工程研究中心旗下的專業(yè)技術(shù)服務(wù)子公司，不斷強(qiáng)化各類生物芯片相關(guān)技術(shù)服務(wù)平臺(tái)建設(shè)，為國內(nèi)外客戶提供專業(yè)化解決方案。在miRNA芯片服務(wù)領(lǐng)域，多年來進(jìn)行了一萬多份樣品的miRNA芯片檢測服務(wù)，協(xié)助客戶發(fā)表SCI論文50余篇，平均IF4.6。

上海伯豪生物技術(shù)有限公司作為Affymetrix認(rèn)證服務(wù)供應(yīng)商，利用Affymetrix最新開發(fā)的 GeneChip® miRNA 4.0 Array為您提供優(yōu)質(zhì)的服務(wù)。

一、芯片特點(diǎn)：

• 高覆蓋度-涵蓋miRBase Release 20中所有成熟的miRNA序列；
• 新型的分析-采用同樣的芯片可以檢測人、小鼠、大鼠或其他物種的miRNA（同時(shí)檢測203個(gè)物種的miRNA）；
• 信息量大-芯片結(jié)果包括：host gene ID、miRNA target genes、clustered miRNA等；
• 樣本量低-僅需要130ng的total RNA。
• 高靈敏度：檢測豐度跨4個(gè)log，可以檢測到1.0 attomol的microRNA含量。
  

 

二、 芯片內(nèi)容：

• 100% 覆蓋miRBase v20數(shù)據(jù)庫；
• 30,424個(gè)成熟miRNA；
• 5,214個(gè)人、小鼠、大鼠miRNA；
• 1,996個(gè)人類snoRNA, scaRNA；
• 3,770個(gè)探針專門針對人類、小鼠、大鼠前體發(fā)夾狀序列設(shè)計(jì)。

探針數(shù)目：（人、大鼠、小鼠）

總探 針數(shù)	人			小鼠		大鼠
	成熟miRNA	Pre-miRNA	sno RNA和scaRNA	成熟miRNA	Pre-miRNA	成熟miRNA	Pre-miRNA
30,424	2,578	2,025	1,996	1,908	1,225	728	490

三、microRNA芯片服務(wù)流程圖

四、數(shù)據(jù)分析：

上海伯豪為客戶整合推出miRNA芯片分析全面解決方案（包括歸一化、差異基因篩選、miRNA靶基因預(yù)測、 miRNA與靶基因網(wǎng)絡(luò)圖、miRNA-GO Network、miRNA-Pathway Network、miRNA的轉(zhuǎn)錄因子的預(yù)測、miRNA與表達(dá)譜芯片平臺(tái)的聯(lián)合分析）。

五、miRBase 20.0數(shù)據(jù)庫相關(guān)更新情況：

miRBase 20.0數(shù)據(jù)庫收錄了來自約40篇新文獻(xiàn)報(bào)道的3355條新的發(fā)夾前體序列和5393條新的成熟體microRNA，miRNA 發(fā)夾前體序列已升至 24521 條；成熟 miRNA 序列升至 30424 條。其中新增成熟 miRNA 中，人成熟的 miRNA 增至 2578 條（新增536條），小鼠成熟的 miRNA 增至 1908 條（新增627條），大鼠 miRNA 增至 728 條。其它物種，Gallus gallus [雞]新增205條, Solanum tuberosum[馬鈴薯]新增332條，Populus trichocarpa [毛果楊]新增32條，Linum usitatissimum[亞麻]新增124條（亞麻為新增物種）。此外，還新增了一系列物種的miRNA序列，包括Ictalurus punctatus [斑點(diǎn)叉尾鮰]，Branchiostoma belcheri[文昌魚]，Avicennia marina[白骨壤]，Prunus persica[碧桃]，Duck enteritis virus [鴨腸炎病毒]等。

六、SBC客戶應(yīng)用案例:

應(yīng)用案例一：
Involvement of microRNA-Mediated Gene Expression Regulation in the Pathological Development of Stem Canker Disease in Populus trichocarpa.
PLOS ONE. 2012,7(9):1-13.
本文運(yùn)用Affymetrix miRNA Array，real-time quantitative PCR (qPCR)來研究miRNAs，通過對miRNA的靶基因及miRNA啟動(dòng)子的分析證實(shí)了被楊樹莖潰瘍病病原及葡萄座腔菌入侵的毛果楊中miRNAs的基因表達(dá)類型。結(jié)果發(fā)現(xiàn)，miR156可能是植物中miRNA應(yīng)答來自環(huán)境中的所有壓力的不可或缺的組件。研究確證了miRNA通路調(diào)節(jié)了植物疾病病理發(fā)展中基因的表達(dá)，為探索楊樹莖潰瘍病的發(fā)生和發(fā)展提供了重要的線索。
使用服務(wù)種類：Affymetrix miRNA Array服務(wù),相關(guān)芯片技術(shù)服務(wù)由上海伯豪完成。

應(yīng)用案例二：
MiR-181a enhances drug sensitivity in mitoxantone-resistant
breast cancer cells by targeting breast cancer resistance protein
(BCRP/ABCG2). Breast Cancer Res Treat.2013, 139:717–730.
乳腺癌耐藥相關(guān)蛋白（BCRP)/ ATP-結(jié)合轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白G超家族成員2（ABCG2）調(diào)節(jié)乳腺癌多種藥物的耐藥性（MDR）。研究者探索了microRNAs在調(diào)節(jié)乳腺癌細(xì)胞中BCRP表達(dá)及BCRP-調(diào)節(jié)的藥物耐藥性方面所發(fā)揮的作用。經(jīng)芯片檢測、熒光素酶活性檢測等方法驗(yàn)證后，最終發(fā)現(xiàn)MiR-181可能是乳腺癌中抑制及逆轉(zhuǎn)藥物耐藥性的潛在靶標(biāo)。
使用服務(wù)種類：Affymetrix miRNA Array服務(wù),相關(guān)芯片技術(shù)服務(wù)由上海伯豪完成。

應(yīng)用案例三：
A dsRNA-binding protein MdDRB1 associated with miRNA biogenesis modifies adventitious rooting and tree architecture in apple. Plant Biotechnology Journal.2013, pp. 1–10.
采用EST blast及RACE擴(kuò)增的方法分離蘋果的MdDRB1基因。接著進(jìn)行表達(dá)分析，RNA結(jié)合及蛋白相互作用分析，將MdDRB1轉(zhuǎn)化進(jìn)蘋果愈傷組織，體外組織培養(yǎng)條件下觀察MdDRB1在miRNA生物起源、不定根生成、葉的生長、樹木生長習(xí)慣方面的典型功能。研究結(jié)果證明MdDRB1在miRNA生物起源方面的功能比較保守，且是果樹重要經(jīng)濟(jì)特征形成的主要調(diào)控因素。
使用服務(wù)種類：Affymetrix miRNA Array服務(wù),相關(guān)芯片技術(shù)服務(wù)由上海伯豪完成。

單位介紹

•        上海伯豪生物技術(shù)有限公司（Shanghai Biotechnology Corporation）是上海生物芯片有限公司/生物芯片上海國家工程研究中心根據(jù)國內(nèi)外研發(fā)外包發(fā)展的需要，整合旗下系統(tǒng)技術(shù)平臺(tái)、商業(yè)化服務(wù)體系、高素質(zhì)服務(wù)團(tuán)隊(duì)等資源成立的致力于研發(fā)外包服務(wù)的專業(yè)化公司。

  上海伯豪生物技術(shù)有限公司擁有六大服務(wù)平臺(tái)：生物樣品分析平臺(tái)、微陣列芯片平臺(tái)、新一代測序平臺(tái)、生物標(biāo)志物平臺(tái)、分子檢測平臺(tái)、生物信息平臺(tái)，憑借高標(biāo)準(zhǔn)的技術(shù)平臺(tái)和多樣化的服務(wù)等競爭優(yōu)勢，公司向國內(nèi)外企業(yè)和相關(guān)單位提供系統(tǒng)的生物學(xué)研究全面解決方案。目前正在為多達(dá)18家跨國制藥企業(yè)（包括排名前10位的跨國制藥企業(yè)）和超過3000家的國內(nèi)科研機(jī)構(gòu)、醫(yī)院等提供基因表達(dá)譜、基因分型、比較基因組學(xué)、DNA甲基化、miRNA、生物標(biāo)志物篩選及確認(rèn)、生物信息等技術(shù)服務(wù)。 

  公司擁有一支以上海為基礎(chǔ)，輻射全國的強(qiáng)大市場營銷隊(duì)伍和銷售網(wǎng)絡(luò)，已設(shè)立華北、華南、華東三個(gè)大區(qū)十五個(gè)辦事處，推廣公司的主導(dǎo)技術(shù)服務(wù)、代理產(chǎn)品，快速提升公司品牌的知名度，擴(kuò)大影響力。過去10年承接項(xiàng)目數(shù)超過10000個(gè)，用戶單位3000家以上，協(xié)助客戶發(fā)表SCI論文700余篇（影響因子共計(jì)3000多分），全面推動(dòng)了中國基因組學(xué)服務(wù)產(chǎn)業(yè)的發(fā)展。 

  公司建立了規(guī)模化的質(zhì)量控制體系，通過了ISO9001: 2008質(zhì)量技術(shù)體系的認(rèn)證，并參照GLP-L的標(biāo)準(zhǔn)，通過128個(gè)SOP文件對項(xiàng)目、樣品、實(shí)驗(yàn)過程、生物信息分析過程、數(shù)據(jù)信息管理、保密等進(jìn)行嚴(yán)格質(zhì)控。尤其是數(shù)據(jù)管理，做到異地備份，保密管理。為用戶的數(shù)據(jù)真實(shí)性、可靠性提供了保證。

  公司的系統(tǒng)化技術(shù)平臺(tái)和高質(zhì)量的服務(wù)體系得到了廣大客戶認(rèn)可和合作伙伴的高度評價(jià)。公司平臺(tái)陸續(xù)獲得了國際知名高通量技術(shù)廠商Illumina、Affymetrix、Agilent、ABI的技術(shù)服務(wù)中心認(rèn)證。公司于2012年獲得諾華（CNIBR）優(yōu)秀供應(yīng)商獎(jiǎng)（Supplier Award 2012）。公司是Affymetrix公司在中國第一家認(rèn)證的服務(wù)提供商，是Agilent公司在國內(nèi)唯一認(rèn)證的服務(wù)提供商，先后被授予“Agilent公司亞太區(qū)最佳服務(wù)供應(yīng)商”和“Affymetrix公司優(yōu)秀服務(wù)商”稱號(hào)。

  
  

單位資質(zhì)

暫無信息