環狀RNA（Circular RNA，circRNA），是一大類具有閉合環狀結構的特殊非編碼RNA。環狀RNA大量存在于真核細胞中，通常具有組織或發育階段的表達特異性，且多數序列高度保守，是扮演重要調控作用的新明星分子。

circRNA在功能上可作為miRNA的海綿吸附體，以ceRNA的機制調控基因；與RNA結合蛋白相互作用而調控其他RNA、編碼蛋白等功能。此外，circRNA由于呈閉合環狀結構，不受RNA外切酶影響，表達更穩定，不易降解。這使得環狀RNA在作為新型臨床診斷標記物的開發應用上具有明顯優勢。

circRNA研究技術線路

芯片特點： 

•  circRNA所有探針設計基于最新最全的國際主流circRNA數據庫信息。
• 環狀RNA -特異的反向剪接位點探針設計，保證每個探針檢測的特異性，避免與母基因之間的冗余影響。

• SBC human circRNA芯片v1.0  用于檢測circRNA表達差異（ 88371個circRNA） 

• SBC human ceRNA芯片 v1.0

用于同時檢測mRNA 、lncRNA 、 circRNA表達差異 （ 88371個circRNA，68423個lncRNA，18853個mRNA）

數據分析流程：

疾病相關環狀RNA預測：

通過環狀RNA及與疾病相關microRNA交互作用分析，并整合已發表GWAS數據預測與疾病相關的環狀RNA。

ceRNA調控分析:

基于基因的表達值，通過回歸模型分析以及種子序列匹配的方法，建立microRNA的海綿吸附作用的調控網絡，找到核心的ceRNA。

注: 線代表不同的microRNA，藍色為mRNA，紅色為circRNA，綠色為lncRNA

經典運用案例——circRNA機制研究 

心臟疾病

      心力衰竭是引起人體死亡的重要疾患之一，而心臟肥大是增加心力衰竭風險的重要因素。針對心臟肥大靶向治療來應對心力衰竭是目前大家所關心的熱點。然而，有關于心臟肥大的調控機制還不是很清楚。

      Circular RANs是一類封閉環狀的非編碼RNA，最近的研究表明，circRNA可以作為內源競爭性RNAs(ceRNAs)來吸附miRNAs調控下游靶基因的表達。該研究從ceRNAs角度出發，解析了在心臟肥大導致心力衰竭的過程中，circRNA的調控機制。

案例：Wang K, Long B, Liu F, Wang JX, Liu CY et al. A circular RNA protects the heart from pathological hypertrophy and heart failure by targeting miR-223. European Heart Journal 2016, Jan 21.

      本研究發現心臟相關的circRNA(HRCR)，可作為miR-223的吸附體，抑制心臟肥大和心力衰竭。miR-223轉基因小鼠表現出心臟肥大和心力衰竭，而miR-223缺失小鼠不受肥大刺激影響。ARC作為miR-223的下游靶基因調控了miR-223導致的心臟肥大。CircRNA HRCR作為miR-223的內源競爭吸附體抑制miR-223的活性，增加ARC的表達。該研究為理解心臟肥大與心力衰竭過程的內在ceRNA調控機制提供了新的見解。

      心臟相關的circRNA可以在體內結合miR-223

經典運用案例——circRNA機制研究

胰島素分泌

      CircRNA Cdr1as最早在斑馬魚胚胎大腦中發現，與大腦發育存在密切關聯。本研究在人體胰島細胞中進行檢測，證明Cdr1as在人體胰島細胞中也能通過吸附miR-7調控胰島素的轉錄和分泌。該研究為提高糖尿病病人的β細胞功能提供了新的見解。

      案例：Xu H, Guo S, Li W, Yu P. The circular RNA Cdr1as, via miR-7 and its targets, regulates insulin transcription and secretion in islet cells. Scientific Reports 2015 Jul 27;5:12453.

      該研究首先在不同的神經內分泌組織中檢測Cdr1as，表明在人和小鼠胰島素細胞中表達豐富。熒光素酶報告系統檢測顯示Cdr1as可以直接抑制miR-7在胰島細胞中的表達，并影響胰島素的分泌和轉錄。生物信息學分析及實驗驗證表明Myrip和Pax6是miR-7的靶基因。過表達Cdr1as可顯著提高Myrip和Pax6的表達。該研究為理解胰島分泌過程中的ceRNA調控機制提供了依據。

β細胞中Cdr1as/miR-7相關network模式圖

經典運用案例——circRNA biomarker研究

外泌體中的circRNA

      circular RNAs是一類廣泛存在的環狀閉合的非編碼RNA，可在體內調控基因的表達。外泌體是一類由細胞分泌的膜狀囊泡結構，其內部含有豐富的物質，包括miRNAs, lncRNA,和circRNAs。外泌體中是否能檢測到穩定存在的circRNA，能否作為疾病診斷的biomarker，該研究通過一系列實驗進行了探索。

      案例：Li Y, Zheng QP, Bao CY, Li SY, Guo WJ et al. Circular RNA is enriched and stable in exosomes: a promising biomarker for cancer diagnosis. Cell Research (2015) 25:981-984.

      該研究首先對肝癌細胞系分離外泌體進行了circRNA檢測，表明細胞分泌外泌體中存在著豐富的circRNAs。隨后對健康人血清來源外泌體進行了檢測，表明血清外泌體中穩定的circRNAs是可能作為診斷biomarker。進一步的小鼠腫瘤模型和臨床直腸癌病人樣本血清外泌體的circRNAs檢測表明，檢測血清外泌體中的circRNA作為臨床診斷的biomarker是可行的。

     CircRNAs在外泌體中是表達豐富和穩定的，可以作為腫瘤檢測的潛在biomarker

單位介紹

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  公司建立了規模化的質量控制體系，通過了ISO9001: 2008質量技術體系的認證，并參照GLP-L的標準，通過128個SOP文件對項目、樣品、實驗過程、生物信息分析過程、數據信息管理、保密等進行嚴格質控。尤其是數據管理，做到異地備份，保密管理。為用戶的數據真實性、可靠性提供了保證。

  公司的系統化技術平臺和高質量的服務體系得到了廣大客戶認可和合作伙伴的高度評價。公司平臺陸續獲得了國際知名高通量技術廠商Illumina、Affymetrix、Agilent、ABI的技術服務中心認證。公司于2012年獲得諾華（CNIBR）優秀供應商獎（Supplier Award 2012）。公司是Affymetrix公司在中國第一家認證的服務提供商，是Agilent公司在國內唯一認證的服務提供商，先后被授予“Agilent公司亞太區最佳服務供應商”和“Affymetrix公司優秀服務商”稱號。

  
  

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