基因表達譜芯片可使科研工作者實現在mRNA水平上同時平行研究成百上千乃至上萬條基因的表達關系。它與傳統(tǒng)的研究基因表達的方法（如差異cDNA文庫篩選、Northern blot和PCR）相比較，可為使用者節(jié)省大量的研究經費和時間， 并獲得范圍更廣、更具有關聯性的研究結果。它的主要用途是用于大規(guī)模分析一定的生物對象在特定生物過程中（如疾病、發(fā)育、分化、凋亡等）基因表達變化的全面信息。目前已經廣泛應用于基因表達檢測、基因功能研究、新基因識別、藥物靶點篩選、藥物作用機理和毒理、疾病相關基因和生物標記物等眾多研究領域。

SBC可為客戶提供Affymetrix、Agilent、Illumina等基因表達譜芯片服務。

服務推薦

芯片名稱		芯片介紹
人表達譜芯片服務	Affymetrix GeneChip Human Genome U133 Plus 2.0 Array	此款芯片包含了47,000個轉錄本，代表了38,500個明晰的人類基因。數據庫來源于GeneBank、dbEST、RefSeq、 UniGene database(Build 159 January 25 2003)、 Washington University EST trace repository、 NCBI human genome assembly(Build 31)。
	Affymetrix GeneChip Human Transcriptome Array 2.0 NEW!	最高分辨率的基因芯片，支持所有轉錄本異構體的全轉錄組分析，包含超過六百萬條不同探針，覆蓋編碼和非編碼轉錄本。 該芯片為每個外顯子設計約10條探針，每個外顯子之間的剪接點有4條探針，確保每個實驗都能獲得完整、準確和可重復的數據。重復性高（批內相關系數≥0.99），所有檢測過的組織觀察到的變異系數（CV）<6.5%。樣品類型既包括新鮮凍存樣品，也包括FFPE 樣本。
	Affymetrix GeneChip PrimeViewTMHuman Gene Expression Array	新版人3’ IVT表達譜卡式芯片，利用GeneChip® Scanner 3000 7G system平臺，據2011年6月份的數據庫設計，覆蓋人類基因組中確認的注解明晰的20000多個基因的36000多個轉錄本，具有超強靈敏度和高度的可重復性，低CV值，完全覆蓋帶注解基因組。
	Affymetrix GeneChip Human Gene 2.0ST Array	Affymetrix新一代全轉錄本芯片，在一張芯片上可以同時檢測mRNA和lincRNA，在其上一代1.0 ST Array的基礎上，該芯片內容進一步豐富并更新數據庫。2.0 ST Array有更多的優(yōu)點：全面覆蓋轉錄組，可以同時檢測>30,000個編碼的轉錄本和>11,000個長鏈非編碼轉錄本；探針設計最大程度覆蓋所有外顯子，可檢測選擇性拼接/轉錄本變體。每個轉錄本覆蓋特異探針的數目中值達到21種，每種探針的長度為25bp，這意味著每個轉錄本將被檢測的堿基數中值高達525個；重復性高；靈敏度高。
	Agilent Whole Human Genome Oligo Microarray 4×44K Kit	Agilent 的人全基因組表達譜芯片匯總目前所了解的人類全基因組序列信息，代表了超過41,000人類基因和轉錄本。設計該產品所用的序列信息源于對 RefSeq、Goldenpath、Ensembl和Unigene 等知名數據庫的深入研究，并與人類基因組拼接進行比對。絕大多數探針經過 Agilent專利的實驗驗證程序的檢驗和優(yōu)化。
	Agilent SurePrint G3 Human Gene Expression 8x60K v2 Microarray Kit	新一代的安捷倫人類表達譜芯片，包含了最新公布的人類lincRNA以及TUCP目錄，據RefSeq數據庫更新了mRNA，其探針覆蓋49,000個轉錄本。
	Agilent SurePrint G3 Human Gene Expression 8x60K Kit	安捷倫人類表達譜芯片，基于G3平臺。除了涵蓋27,958條Entrez Gene RNAs外，更涵蓋7,419條lincRNA。不僅能檢測蛋白編碼RNA表達量的變化，也能檢測非編碼RNA的表達量變化。探針設計參照的數據庫為：RefSeq Build 36.3；Ensemble Release 52；Unigene Build 216；GenBank (April 2009)。非編碼RNA探針是和John Rinn 實驗室（隸屬于麻省理工學院-哈佛大學博德研究所）共同設計的。
	Illumina HumanHT-12 v4 Expression BeadChip	該全基因組表達譜芯片包括超過47,000個探針，覆蓋31,000多個注釋基因，可同時檢測12個樣本。信息來源RefSeq 數據庫 ( Release38)，UniGene 數據庫 (Build 199)。
小鼠表達譜芯片服務	Affymetrix GeneChip Mouse Genome 430 2.0 Array	Affymetrix 小鼠基因組430 2.0芯片涵蓋了39,000個轉錄本，代表34,000個明晰的小鼠基因。序列信息基于GeneBank、dbEST、RefSeq、UniGene database。
	Affymetrix GeneChipMouse Transcriptome Assay 1.0 NEW!	最高分辨率的小鼠基因芯片，支持所有轉錄本異構體的全轉錄組分析，覆蓋超過23,000個編碼基因(其中包括超過114,000個轉錄本; 332,000個外顯子以及215,000個外顯子簇)和超過55,000個非編碼基因（其中包括101,000個轉錄本; 222,000個外顯子以及162,000個外顯子簇）。該芯片為每個外顯子設計約10條探針，每個外顯子之間的剪接點有4條探針，確保每個實驗都能獲得完整、準確和可重復的數據。重復性高，批內相關系數≥0.99。樣品類型既包括新鮮凍存樣品，也包括FFPE 樣本。這種芯片的應用將加快人類疾病的臨床前研究，提高了從小鼠模型研究轉化到人類疾病研究的成功率。
	Affymetrix GeneChip Mouse Gene 2.0 ST Array	小鼠全轉錄本芯片，在一張芯片上可以同時檢測mRNA和lincRNA，可同時檢測>35,000個編碼的和非編碼的轉錄本及>2,000個長鏈基因間非編碼轉錄本
	Agilent Whole Mouse Genome Oligo Microarray, 4×44K	Agilent 小鼠全基因組表達譜芯片真正代表小鼠基因組中所有已知基因及其產生的轉錄本，代表了超過 41,174 個小鼠基因和轉錄本。設計該產品所用的序列信息源于對 UCSC、NIA、RefSeq、Ensembl、Unigene和RIKEN等知名數據庫的深入研究，而且絕大多數探針經過Agilent專利的實驗驗證程序的檢驗和優(yōu)化。
	Agilent SurePrint G3 Mouse Gene Expression 8x60K Kit	安捷倫最新設計的小鼠表達譜芯片，基于G3平臺。除了涵蓋39,430條Entrez Gene RNAs外，更涵蓋16,251條lincRNA。不僅能檢測蛋白編碼RNA表達量的變化，也能檢測非編碼RNA的表達量變化。探針設計參照的數據庫為：RefSeq Build 37；Ensembl Release 55；Unigene Build 176；GenBank (April 2009)；RIKEN 3。
	Illumina MouseRef-8 v2 Expression BeadChip	該全基因組表達譜芯片包括約25,600個轉錄本, 參考數據庫為：NCBI RefSeq（Build 36, Release 22）。
	Illumina MouseWG-6 v2 Expression BeadChip	該全基因組表達譜芯片包括約45,200個轉錄本，參考數據庫為：NCBI RefSeq（Build 36, Release 22）；RIKEN FANTOM2；MEEBO。
大鼠表達譜芯片服務	Affymetrix GeneChip Rat Genome 230 2.0 Array	Affymetrix 大鼠基因組230 2.0芯片包含有31,000個probe sets，代表28,000個明晰的大鼠基因。序列信息基于GenBank , dbEST, RefSeq等權威數據庫。
	Affymetrix GeneChip Rat Gene 2.0 ST Array	大鼠全轉錄本芯片，在一張芯片上可以同時檢測mRNA和lincRNA，可同時檢測>27,000個蛋白編碼轉錄本及>23,500個  Entrez基因
	Agilent Whole Rat Genome Oligo Microarray, 4×44K	Agilent 大鼠全基因組表達譜芯片真正代表大鼠基因組中所有已知基因及其產生的轉錄本，代表了超過 41,012 個大鼠基因和轉錄本。設計該產品所用的序列信息源于對 RefSeq、Ensembl、Unigene 和GenBank等知名數據庫的深入研究，而且絕大多數探針經過Agilent專利的實驗驗證程序的檢驗和優(yōu)化。
	Agilent SurePrint G3 Rat Gene Expression 8x60K Kit	安捷倫最新設計的大鼠表達譜芯片，基于G3平臺。涵蓋30,003條Entrez Gene RNAs。探針設計參照的數據庫為：RefSeq Build 36.2；Ensembl Release 55；Unigene Build 177；GenBank (January 2009)。

SBC提供其它物種的表達譜芯片

Affymetrix 3' IVT Expression Array: 擬南芥、苜蓿、稻、大豆、大麥、小麥、柑橘、棉花、玉米、白楊、甘蔗、西紅柿、葡萄、酵母、果蠅、秀麗隱桿線蟲、牛、犬、雞、豬、恒河猴、非洲爪蟾、熱帶爪蟾、斑馬魚。

Affymetrix Gene 1.0 ST Array : 擬南芥、苜蓿、稻、大豆、果蠅、秀麗隱桿線蟲、牛、犬、雞、豬、恒河獼猴、食蟹獼猴、馬、貓、豚鼠、狨猴、羊、兔、恒河猴、斑胸草雀、斑馬魚、番茄。

Agilent 3' IVT Expression Array：擬南芥、苜蓿、稻、大麥、棉花、蕓苔屬植物、煙草、西紅柿、小麥、酵母、大腸桿菌、稻瘟菌、果蠅、秀麗隱桿線蟲、蚊子、牛、犬、雞、豬、馬、恒河猴、兔、三文魚、羊、非洲爪蟾、斑馬魚。

FFPE樣品的表達譜芯片服務
芯片推薦：Illumina Human Whole-Genome DASL HT Assay BeadChip
芯片介紹：Human Whole-Genome DASL（cDNA介導的退火、選擇、延伸和連接）Assay是唯一一個能從低豐度或部分降解的人RNA樣本中產生全基因組表達圖譜的優(yōu)化整合系統(tǒng)，特別適用于那些來自甲醛固定石蠟包埋（FFPE）組織的RNA樣本。芯片覆蓋約29,000個轉錄本。信息來源RefSeq 數據庫 (Build 36.2, Release 38)。

芯片推薦：Affymetrix Almac XcelTM Array
芯片介紹：Almac XcelTM芯片是目前市場上唯一一款為福爾馬林石蠟包埋(FFPE)樣本設計和優(yōu)化的3' 端表達譜芯片。芯片包含了針對97,000多個轉錄本的探針組，其中許多是其他芯片沒有的。芯片約70%內容與GeneChip Human Genome U133 Plus 2.0 芯片的內容相同。還有8%是U133 plus 2.0芯片未包含的經過驗證的RefSeq更新信息，其余22%來自高質量的Almac公司內部測序數據和驗證過濾后的公開數據。 
Affymetrix GeneChip Human Transcriptome 2.0 Array和Affymetrix GeneChip Human Genome U133 Plus 2.0 Array這兩款芯片在我們已經服務過的FFPE樣品表達譜檢測應用中也同樣表現優(yōu)異。

單位介紹

•        上海伯豪生物技術有限公司（Shanghai Biotechnology Corporation）是上海生物芯片有限公司/生物芯片上海國家工程研究中心根據國內外研發(fā)外包發(fā)展的需要，整合旗下系統(tǒng)技術平臺、商業(yè)化服務體系、高素質服務團隊等資源成立的致力于研發(fā)外包服務的專業(yè)化公司。

  上海伯豪生物技術有限公司擁有六大服務平臺：生物樣品分析平臺、微陣列芯片平臺、新一代測序平臺、生物標志物平臺、分子檢測平臺、生物信息平臺，憑借高標準的技術平臺和多樣化的服務等競爭優(yōu)勢，公司向國內外企業(yè)和相關單位提供系統(tǒng)的生物學研究全面解決方案。目前正在為多達18家跨國制藥企業(yè)（包括排名前10位的跨國制藥企業(yè)）和超過3000家的國內科研機構、醫(yī)院等提供基因表達譜、基因分型、比較基因組學、DNA甲基化、miRNA、生物標志物篩選及確認、生物信息等技術服務。 

  公司擁有一支以上海為基礎，輻射全國的強大市場營銷隊伍和銷售網絡，已設立華北、華南、華東三個大區(qū)十五個辦事處，推廣公司的主導技術服務、代理產品，快速提升公司品牌的知名度，擴大影響力。過去10年承接項目數超過10000個，用戶單位3000家以上，協(xié)助客戶發(fā)表SCI論文700余篇（影響因子共計3000多分），全面推動了中國基因組學服務產業(yè)的發(fā)展。 

  公司建立了規(guī)模化的質量控制體系，通過了ISO9001: 2008質量技術體系的認證，并參照GLP-L的標準，通過128個SOP文件對項目、樣品、實驗過程、生物信息分析過程、數據信息管理、保密等進行嚴格質控。尤其是數據管理，做到異地備份，保密管理。為用戶的數據真實性、可靠性提供了保證。

  公司的系統(tǒng)化技術平臺和高質量的服務體系得到了廣大客戶認可和合作伙伴的高度評價。公司平臺陸續(xù)獲得了國際知名高通量技術廠商Illumina、Affymetrix、Agilent、ABI的技術服務中心認證。公司于2012年獲得諾華（CNIBR）優(yōu)秀供應商獎（Supplier Award 2012）。公司是Affymetrix公司在中國第一家認證的服務提供商，是Agilent公司在國內唯一認證的服務提供商，先后被授予“Agilent公司亞太區(qū)最佳服務供應商”和“Affymetrix公司優(yōu)秀服務商”稱號。

  
  

單位資質

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